A punção da medula óssea é geralmente indolor, uma vez que é normalmente realizada com uma injecção subcutânea de anestésico e o local da punção é geralmente a área esponjosa da espinha ilíaca superior anterior, que se encontra mesmo debaixo da pele e é mais dolorosa quando o anestésico é administrado. A agulha de punção da medula óssea é introduzida directamente na medula óssea ao longo da osteófita da coluna ilíaca superior anterior para extrair células da medula óssea e sangue da medula óssea, que se sentirá dorida e inchada. Após a punção, à medida que a anestesia se desgasta, pode sentir uma ligeira dor no olho da punção, como se fosse uma agulha. É portanto aconselhável evitar tomar banho directamente após a punção e esperar 48 horas para que a ferida cicatrize antes de tomar banho, e evitar tomar banho durante demasiado tempo, uma vez que o local da punção é propenso a infecções.