As pedras nas amígdalas não podem ser tratadas com sprays e requerem uma visita ao hospital, onde podem ser tratadas com gargarejos, remoção de pedras e amigdalectomia sob a direção de um médico. Após a alimentação diária, é frequente ficarem resíduos de comida nas criptas das amígdalas. Ao mesmo tempo, as glândulas das amígdalas produzem secreções que contêm cálcio e outros sais inorgânicos, que se depositam facilmente na fossa amigdalina. Com o passar do tempo, estes depósitos transformam-se em pedras das amígdalas. Quando as pedras das amígdalas são pequenas, não há desconforto evidente. Quando os cálculos são grandes, pode haver mau hálito, dor de garganta, garganta seca, sensação de corpo estranho, tosse repetida e outros sintomas. Para gargarejar, pode utilizar-se água salgada ou gargarejo com ácido bórico. O gargarejo deve estar totalmente em contacto com os dentes, as gengivas e limpar repetidamente todas as partes da boca, o que ajuda a remover as bactérias orais. Os antibióticos podem ser utilizados quando a irritação do cálculo provoca uma inflamação periférica. Para pedras teimosas, o efeito não cirúrgico do tratamento não é bom, e as partículas de pedra são muitas, cirurgia de amigdalectomia viável, as amígdalas e pedras juntamente com a remoção. Os doentes podem limpar a superfície dos cálculos das amígdalas em casa, gargarejando repetidamente, e recomenda-se a consulta hospitalar para um tratamento normalizado quando ocorre desconforto.