O Staphylococcus aureus é atualmente preferido às penicilinas semi-sintéticas resistentes à penicilinase, como a benzatina sódica, ou aos aminoglicosídeos, como as cefalosporinas e a amicacina. Atualmente, a taxa de resistência do S. aureus à penicilina é muito elevada, pelo que se prefere frequentemente a penicilina semi-sintética resistente à penicilinase ou as cefalosporinas, como a benzoxacilina sódica e a cloxacilina; os aminoglicosídeos, como a amicacina, também podem ser aplicados em combinação. A amoxicilina e a ampicilina também são eficazes nalgumas populações. Algumas pessoas são resistentes aos medicamentos à base de meticilina; este tipo de pessoas necessita normalmente de efetuar o teste de sensibilidade à vancomicina e a outros medicamentos; se forem sensíveis, podem aplicar vancomicina, ticoranina e outros antibióticos para tratamento. Quando infectados com Staphylococcus aureus, a medicação empírica deve ser administrada sob a orientação de um médico, juntamente com testes de sensibilidade a medicamentos, para selecionar medicamentos sensíveis para tratamento.