A cirurgia de substituição do joelho é um procedimento arriscado porque é uma grande cirurgia, é traumática e leva muito tempo a ser realizada. Durante a operação, devido ao grande trauma e à necessidade de osteotomia, há um risco de hemorragia maciça, que pode levar a uma queda na circulação e possivelmente choque, e mesmo que o sangue seja substituído, há um risco de alergia e transfusão. Além disso, durante a operação, as partículas de gordura podem entrar na circulação venosa através dos vasos sanguíneos rompidos e eventualmente atingir o coração e depois os pulmões, resultando numa embolia pulmonar, o que pode também levar a uma insuficiência respiratória e afectar a segurança da vida. Após a operação estar concluída, existe o risco de trombose venosa profunda nos membros inferiores, bem como infecção da ferida, devido à necessidade de estar acamada durante um período de tempo mais longo. No entanto, isto é apenas relativo. Para os pacientes com uma má função do joelho que afecta a sua qualidade de vida, a substituição do joelho é essencial e os benefícios superam de longe as desvantagens.