A vacina contra o HPV é segura a mais de 95% e é utilizada principalmente para prevenir o cancro do colo do útero, a vacina chegou tarde. A vacina contra o cancro do colo do útero é como outras vacinas, tais como a vacina contra o sarampo, a vacina contra a difteria e a vacina contra a raiva. A maioria dos indivíduos terá uma protecção eficaz após a injecção, com apenas um número muito pequeno a sofrer alguns efeitos inseguros, principalmente relacionados com a constituição do indivíduo ou se a mulher tivesse uma infecção, febre ou alergia antes da injecção. A vacinação estimula o corpo a produzir uma certa resposta imunológica e pode, portanto, levar à febre, vermelhidão, inchaço e eritema. Isto irá diminuir após 12 dias com o tratamento sintomático e não representará uma ameaça à vida e à saúde. Existem riscos associados a qualquer vacinação e, portanto, não pode ser 100% segura e eficaz e precisa de ser tratada correctamente.