A realização ou não de uma gastroscopia para recolha de tecido para biópsia, que é uma patologia, depende principalmente da presença e da gravidade das lesões no estômago do doente e, por outro lado, do nível de julgamento e de decisão do endoscopista. Em primeiro lugar, o fator doente. Se o doente tiver lesões no estômago, se a mucosa for lisa, se as pregas mucosas forem normais, se a parede do estômago tiver uma cor normal, se não houver congestão, erosões ou úlceras, não é necessário efetuar uma biopsia para exame anatomopatológico. No entanto, se a mucosa da parede do estômago for anormal, mas se se tratar de uma gastrite crónica superficial comum ou de uma úlcera ligeira, o endoscopista fará normalmente o diagnóstico de gastrite crónica ou de úlcera gástrica e não será efectuada uma biopsia. No entanto, se a erosão da mucosa e a ulceração da parede do estômago forem graves, será efectuada uma biopsia para esclarecer a natureza, se se trata de uma inflamação geral ou de uma úlcera cancerosa. É importante notar que, por vezes, o cancro e a úlcera coexistem e, mesmo que seja feita uma biópsia e os resultados da patologia indiquem apenas uma inflamação, se o endoscopista considerar que a úlcera não está bem apresentada, é melhor rever a gastroscopia novamente após 2-3 semanas de medicação oral para a úlcera (omeprazol e protetor da mucosa gástrica) para evitar perder o diagnóstico de cancro gástrico. Na prática clínica, este tipo de situação é frequente e os doentes são por vezes submetidos a 3-4 biopsias gastroscópicas antes de o diagnóstico de cancro gástrico ser confirmado. Outra situação em que é necessária uma biopsia é quando se encontra uma lesão ocupante no estômago. Em termos leigos, é quando se encontra um crescimento no revestimento do estômago, que pode ser benigno ou, claro, pode ser cancro gástrico. É nesta altura que deve ser feita uma biopsia para esclarecer a natureza e orientar o plano de tratamento. A exceção é quando a massa não está a crescer na mucosa gástrica, mas sim sob a mucosa, e a mucosa patente é lisa, o que é mais conhecido como um tumor mesenquimal gástrico (GIST), ver o diagrama abaixo. Quando se suspeita de um tumor mesenquimatoso, não se deve efetuar uma biopsia, uma vez que é propenso a perfuração e rutura, levando a metástases e recidivas. Existe também um fator médico na realização ou não de uma biopsia. Os principais factores são a competência do médico, o nível de exame e a experiência no tratamento. Um médico experiente, sobretudo um médico especializado em oncologia, estará particularmente atento ao risco de cancro. Em caso de suspeita de cancro, é mais provável que, por precaução, seja retirado tecido para exame patológico. Em particular, os hospitais especializados em oncologia ou os que dispõem de um elevado nível de tratamento do cancro gástrico dispõem geralmente de vários métodos de endoscopia, como a endoscopia de ampliação e a endoscopia de coloração, para esclarecer melhor se existe um risco de cancro e a possibilidade de falhar o diagnóstico de cancro gástrico será mínima. No caso dos médicos menos experientes, ou das salas de endoscopia dos hospitais gerais, as doenças gástricas encontradas são geralmente úlceras e inflamações benignas e, mesmo que se observem alterações da mucosa do estômago, são tratadas como gastrite geral e úlceras gástricas sem biópsia, perdendo-se assim a oportunidade de detetar precocemente o cancro gástrico. Há quem diga: a que nível, como é que não se consegue sequer distinguir entre cancro gástrico e inflamação? Porquê? Porque não existe uma diferença óbvia entre o cancro gástrico precoce e a gastrite geral ou a úlcera gástrica. Só um endoscopista de nível superior pode ser capaz de detetar certas diferenças através da forma da úlcera, da sua profundidade, das alterações nas pregas da mucosa, etc., e, se estiver alerta, fará uma biopsia. O cancro gástrico precoce, tal como se mostra no diagrama, é por vezes difícil de distinguir de uma úlcera gástrica. Por isso, na prática clínica, muitos médicos são agressivos na realização de biópsias assim que são detectadas alterações na mucosa gástrica. Só assim é possível detetar o maior número possível de cancros gástricos precoces e reduzir a taxa de diagnósticos falhados.