A nucleotidase elevada pode também ser devida a factores fisiológicos. Os nucleótidos elevados causados por factores fisiológicos não têm sintomas clínicos e podem voltar ao normal depois de o gatilho ter sido removido. Muitas lesões hepáticas podem também causar nucleotidase elevada, quer benigna ou maligna. No entanto, as mais comuns são icterícia obstrutiva, cancro primário do fígado e várias hepatites agudas e crónicas. O diagnóstico clínico e o diagnóstico diferencial de doenças do sistema hepatobiliar pode ser feito por enzimas nucleotídicas. Claro que, quando estas doenças hepatobiliares estão em remissão, as nucleotídeas também podem diminuir até certo ponto e podem, portanto, ser utilizadas para avaliar a recuperação. Contudo, a nucleotídase não é um teste de rotina na prática clínica. Testes básicos como a fosfatase alcalina, transaminase, glutamil transpeptidase e bilirrubina são suficientes para o diagnóstico de doenças hepatobiliares.