A endoscopia da cápsula baseia-se principalmente na ingestão da cápsula, gravação e observação da reprodução. A endoscopia da cápsula pode ser realizada na presença de hemorragia gastrointestinal inexplicada, suspeita de anemia por deficiência de ferro, tumores do intestino delgado, desconforto frequente no estômago, náuseas, vómitos, refluxo ácido, arrotos e dor no estômago. O tracto gastrointestinal do doente precisa de ser limpo antes do exame, que é essencialmente o mesmo que a preparação para a colonoscopia. Uma vez dentro do corpo, o endoscópio em cápsula seguirá os movimentos peristálticos do tracto gastrointestinal ao longo de todo o corpo, tirando uma fotografia a intervalos de dois segundos de cada vez, e a informação das imagens tiradas será transmitida a um gravador de imagens fora do corpo a qualquer momento. O médico observará e analisará as imagens do gravador de imagens e poderá ajudar o paciente a determinar se uma doença está presente. Após 8-72 horas de ingestão da cápsula, o endoscópio da cápsula será expulso do corpo com as fezes do corpo.