A pielonefrite crónica é geralmente tratada com antibióticos, tais como os antibióticos cefalosporinos e a medicina chinesa. As manifestações clínicas da pielonefrite crónica incluem episódios intermitentes de frequência urinária, urgência, micção dolorosa, dores nas costas ou bacteriúria assintomática. O tratamento é geralmente baseado em cultura de urina e testes de sensibilidade aos medicamentos para determinar o agente causador e seleccionar o antibiótico apropriado. Os antibióticos comummente utilizados incluem antibióticos de cefalosporina, tais como ceftriaxona sódica, cefminox, cefixima, etc. Os medicamentos à base de ervas chineses também podem ser aplicados para tratamento, e as fórmulas de ervas comummente utilizadas incluem Bazheng San e Tonic Zhong Yi Qi Tang. Os medicamentos normalmente utilizados incluem Bupleurum, Plantain, e Shivee. Com os tratamentos activos acima mencionados, a pielonefrite crónica pode ser melhor controlada ou mesmo curada.