A metformina é excretada na sua forma original através dos túbulos renais, onde a sua depuração é 3,5 vezes superior à da creatinina, e não é intrinsecamente prejudicial para os rins. A metformina é excretada através dos rins e uma insuficiência renal grave pode levar à acumulação de metformina no organismo, com o risco de exacerbar a acidose láctica. A International Diabetes Federation IDF recomenda que a metformina seja contra-indicada em eGFR < 30 ml/min (insuficiência renal grave). Para os doentes que necessitam de tomar metformina, recomenda-se que procurem activamente aconselhamento médico para desenvolver o uso e dosagem adequados com a ajuda de um médico, e os doentes precisam de evitar administrar o fármaco cegamente por si próprios.