O ácido azelaico é habitualmente utilizado clinicamente sob a forma de creme, os principais efeitos secundários são sintomas de irritação da pele, alguns doentes podem apresentar pele seca, eritema, descamação, dermatite de contacto e outras reacções adversas. Os efeitos secundários do creme de ácido azelaico são geralmente ligeiros e transitórios, alguns doentes podem sentir comichão local, ardor, formigueiro e outros sintomas de irritação da pele quando utilizam o medicamento pela primeira vez, outras reacções adversas incluem pele seca, descamação, dermatite, eritema, etc., com uma incidência total inferior a 1%, e um número muito pequeno de doentes com a utilização do medicamento pode apresentar manchas brancas, hirsutismo, vermelhidão, agravamento da asma e outros efeitos secundários. É de notar que a utilização do creme de ácido azelaico é proibida para quem é alérgico a qualquer componente do medicamento, e o local de aplicação não deve ser utilizado como uma ligadura fechada. Os pacientes devem seguir as instruções do médico para usar o medicamento, se ocorrer desconforto grave durante o uso do medicamento, devem interromper imediatamente o medicamento, se necessário, procurar atendimento médico.