A faringite não se transforma em DEFM. Embora ambas sejam causadas por infecções virais e ambas possam apresentar sintomas de herpes na orofaringe no início, são doenças diferentes e não estão necessariamente relacionadas. A faringite é geralmente causada por infecções como o coxsackievirus, clostridium difficile, EBV e estreptococos hemolíticos. As infecções estão mais frequentemente associadas à diminuição da imunidade, incluindo o desperdício de doenças (por exemplo, malignidade), desnutrição, esforço, e o uso de drogas que suprimem a função imunológica. Além disso, a leucemia também pode levar a danos no tecido mucoso do istmo faríngeo, causando uma resposta inflamatória. HFMD é causado por uma variedade de infecções por enterovírus que invadem o corpo através das vias respiratórias ou digestivas, sendo o coxsackievírus A16 e o enterovírus 71 os mais comuns. Os enterovírus infectam o corpo e podem replicar-se em grande número nas amígdalas, faringe e gânglios linfáticos do intestino, e depois ser libertados na corrente sanguínea, espalhando-se ainda mais para a pele e membranas mucosas, sistema nervoso, sistema respiratório, coração, fígado, pâncreas e glândulas supra-renais, causando uma série de reacções inflamatórias nos tecidos e órgãos correspondentes, e levando às manifestações clínicas correspondentes. Em resumo, a faringite e a DMF são doenças diferentes e não há hipótese de a faringite se transformar em DMF. Os doentes com faringite ou DEFM são aconselhados a procurar atenção médica activa para melhorar o seu prognóstico.