O principal tratamento para crianças com hipotiroidismo é a terapia de reposição da hormona tiroidiana. Há muitas razões para o desenvolvimento do hipotiroidismo na infância, a maioria das quais se deve ao hipotiroidismo primário. Neste caso, a terapia de substituição é administrada em diferentes doses de eugenol em diferentes fases do crescimento e desenvolvimento da criança, dependendo da idade e do peso do paciente. Além disso, deve ser dada atenção a se este grupo de crianças tem uma combinação de outras doenças endócrinas. Uma vez que muitas crianças com hipotiroidismo têm outros problemas de glândulas endócrinas, é importante tratar a criança se forem identificadas outras anomalias das glândulas endócrinas, para que a falta ou níveis anormais de hormonas endócrinas não afectem o desenvolvimento da criança. Portanto, a terapia de reposição hormonal da tiróide pode ser dada às crianças hipotiróides quando a causa for identificada.