O princípio da terapia magnética transcraniana baseia-se no princípio da estimulação electromagnética, que pode melhorar a excitabilidade do cérebro e regular a libertação de neurotransmissores. A terapia de estimulação magnética transcraniana é uma técnica de neuroestimulação não invasiva, que é habitualmente utilizada clinicamente para o tratamento de perturbações de ansiedade, perturbações afectivas bidireccionais, depressão, perturbações do sono e como tratamento adjuvante da medicação, podendo melhorar significativamente os sintomas mentais. A estimulação magnética transcraniana de alta frequência e alta intensidade produz uma soma de potenciais pós-sinápticos excitatórios, levando a uma excitação anormal dos nervos no local da estimulação. A estimulação de baixa frequência tem o efeito oposto, tratando a doença através da regulação bidirecional do equilíbrio entre as funções cerebrais excitatórias e inibitórias. Para diferentes doentes com diferentes condições de funcionamento do cérebro, devem ser ajustadas diferentes intensidades, frequências, locais de estimulação e direcções da bobina para obter um bom efeito terapêutico. Os efeitos adversos mais comuns da terapia magnética transcraniana incluem perda súbita de audição e convulsões, bem como dores de cabeça e tonturas. A terapia magnética transcraniana deve ser efectuada de acordo com o aconselhamento médico e requer pessoal profissional para realizar o tratamento.