A maioria dos casos de esclerose múltipla não é clinicamente elegível para a vacina New Crown e apenas uma pequena percentagem de doentes estáveis a longo prazo é considerada elegível. A esclerose múltipla é a doença desmielinizante inflamatória imunomediada mais comum do sistema nervoso central (SNC), se a doença estiver ativa ou a tomar medicamentos imunossupressores orais, desta vez para ir para a nova vacina da coroa, a nova vacina da coroa será menos eficaz, para além da possibilidade de exacerbação da doença original. Se alguns dos doentes tiverem recuperado completamente após o tratamento sistemático e continuarem estáveis, este tipo de doentes pode tentar obter a nova vacina da coroa. Se os doentes com esclerose múltipla tiverem de ser vacinados com a vacina New Crown, recomenda-se que se dirijam a um centro de vacinação sob a supervisão de um especialista.