A TC e a RM têm as suas próprias vantagens e o seu foco é diferente, pelo que não é possível generalizar qual é melhor, mas sim determinar qual o teste a realizar em função do estado específico do corpo em caso de doenças diferentes. Por exemplo, a TC é capaz de examinar a maioria dos órgãos do corpo, especialmente os pulmões e a cabeça, enquanto que os ossos e as articulações estão em desvantagem. A TC tem uma certa quantidade de radiação, enquanto que a RM não tem, e é adequada para um maior número de pessoas, mas a RM não é adequada para pacientes com corpos estranhos metálicos.