1. leucemia em remissão completa; 2. anemia aplástica com um doador totalmente compatível; se a terapia convencional hemifásica não for eficaz e dependente de transfusão; 3. linfoma estádio III-IV; 4. leucemia refractária recaída; 5. síndrome mielodisplásica. O transplante não é necessário para a leucemia linfóide aguda de baixo ou médio risco em crianças, mas o transplante é mais eficaz do que a quimioterapia em pacientes de alto risco ou tipos de refractários recaídos.