Os sintomas da DRGE podem facilmente ser confundidos com muitas outras doenças e os pacientes muitas vezes não se apercebem de que têm a doença, ou se a têm, não a levam suficientemente a sério devido a uma falta de conhecimento sobre a doença. Os perigos da DRGE incluem a redução da qualidade de vida dos pacientes, causando várias complicações e até mesmo o cancro e a morte. Os vários sintomas da DRGE, que podem repetir-se, causam angústia a longo prazo na vida dos pacientes e são frequentemente mais pronunciados à noite, afectando o sono e causando aborrecimento, enquanto o estado psicológico e mental agravado pela doença pode exacerbá-lo, criando um ciclo vicioso. Se não for tratada, a DRGE pode provocar complicações como asma, pneumonia por aspiração, fibrose pulmonar, otite média e estricção do esófago, fazendo com que os pacientes sofram mais dor e pior qualidade de vida. Muitos casos de GERD são causados por hérnia hiatal esofágica. Casos graves de hérnia hiatal esofágica, se não forem operados, podem levar à necrose e perfuração do estômago, com consequências extremamente graves. No GERD, o ácido estomacal e a bílis irritam repetidamente a mucosa esofágica, provocando a sua erosão e ulceração, o que, com o tempo, pode levar ao cancro do esófago. Quando o ácido estomacal refluxado entra na traqueia, pode causar reacções respiratórias graves e pode mesmo levar ao laringoespasmo e à morte do paciente.