Os sintomas da doença são variados e frequentemente confundidos com muitas doenças digestivas, respiratórias e do ouvido, nariz e garganta, o que facilita não só aos pacientes mas também aos médicos ignorar a possibilidade de DRGE, levando a diagnósticos e diagnósticos errados. Dependendo da fase de progressão da doença, os seguintes sintomas podem estar presentes em geral. Estágio gastro-esofágico: Os sintomas mais comuns da DRGE nesta fase são a azia e o refluxo ácido, que se encontram principalmente no esófago. A azia é quando o doente sente uma sensação de ardor na zona anterior do tórax e na fossa do coração. O refluxo ácido é quando o doente sente uma onda de ácido a sair do abdómen para a boca na ausência de náuseas, vómitos, etc. Além disso, alguns doentes podem sentir dores no peito, aperto no peito e indigestão. Fase faríngea: Quando o refluxo piora e as lesões se desenvolvem no esófago superior e faringe, os pacientes podem desenvolver sintomas semelhantes à faringite aguda e crónica, a maioria das vezes uma tosse crónica inexplicável, geralmente seca, que os pacientes tratam repetidamente nos departamentos respiratórios ou otorrinolaringológicos sem melhoria significativa, enquanto alguns pacientes desenvolvem uma tosse nocturna recorrente que interfere com o repouso. Os pacientes também podem sentir desconforto, como formigueiro na garganta, sensação de corpo estranho e dor de garganta. Fase oral e nasal: Quando o refluxo se agrava, as membranas mucosas da boca, nariz e ouvido médio ficam doentes e o doente pode apresentar sintomas tais como nariz a pingar, espirros, congestão nasal e zumbido, o que pode mesmo levar a otite média. Fase laringotraqueal: Quando o regurgitante entra na traqueia, causa sintomas tais como tosse, tosse para a expectoração, falta de ar e respiração retardada. Há muitos doentes cujos sintomas são muito semelhantes a um ataque de asma, mas que são tratados para a asma no departamento respiratório com maus resultados. Quando a doença tiver progredido até esta fase, já é mais grave e pode levar a uma redução significativa da qualidade de vida do paciente e até mesmo a um laringoespasmo com risco de vida.