Os pólipos cólon são também muito comuns e podem frequentemente ser encontrados na colonoscopia. Os pólipos cólon são geralmente divididos em dois tipos, pólipos hiperplásicos e pólipos adenomatosos. Os pólipos adenomatosos são subdivididos em adenomas tubulares, adenomas de vilas e também adenomas mistos. As biópsias são realizadas para distinguir a natureza dos pólipos de cólon, uma vez que o prognóstico para estes dois tipos de pólipos é diferente. Os pólipos proliferativos não são cancerosos, enquanto que os pólipos adenomatosos têm tendência para se tornarem cancerosos, especialmente os adenomas das vilas, que têm uma taxa de cancro muito elevada. Portanto, a biopsia dos pólipos de cólon é muito importante para a etapa seguinte do tratamento, bem como para a prevenção e prognóstico, pelo que a biopsia deve ser realizada.