O aumento do amoníaco no sangue pode ter consequências adversas óbvias para o organismo. As consequências do aumento do amoníaco no sangue têm duas vertentes: em primeiro lugar, efeitos directos no sistema nervoso central, uma vez que o amoníaco no sangue pode ter um efeito tóxico óbvio no sistema nervoso central, conduzindo a uma série de sintomas como coma consciente, delírio e mania, frequentemente designados clinicamente por encefalopatia hepática. Em segundo lugar, as consequências da elevação do amoníaco no sangue estão também intimamente relacionadas com as doenças específicas que causam a elevação do amoníaco no sangue. Clinicamente, as doenças mais comuns que causam a elevação do amoníaco no sangue são várias doenças hepáticas, como a cirrose hepática e o cancro do fígado, que podem ter consequências diferentes, por exemplo, os doentes com cancro do fígado têm lesões graves nas células hepáticas e, se ocorrerem sintomas de insuficiência hepática, manifestam-se como aumento das transaminases, esclerótica amarela, diminuição do apetite, ascite, distensão abdominal e até mesmo levar à morte do doente. Assim, as consequências de um nível elevado de amoníaco no sangue têm duas partes: uma parte são os sintomas do sistema nervoso central e a outra parte são os sintomas da causa primária do nível elevado de amoníaco no sangue.