Um é um teste de imagem e o outro é um procedimento cirúrgico mais patologia. Não há comparação entre os dois, mas uma biópsia de perfuração é o padrão de ouro para o diagnóstico de nódulos da tiróide. Por exemplo, os doentes com múltiplos nódulos podem ser rastreados com ultra-sons para ver qual o nódulo com maior probabilidade de ser maligno e selectivamente biopsiado por punção, ou se o nódulo tiver uma ecogenicidade forte ou fraca, a ultra-sonografia pode ser utilizada para determinar qual a parte do nódulo com maior probabilidade de ser puncionada. A ultra-sonografia é um método que reflecte a perfusão global do nódulo e é uma avaliação mais precisa do estado do nódulo do que 2D, especialmente se o nódulo for grande e sangrar, formando um hematoma no nódulo, que lentamente absorve com o tempo e depois se consolida, parecendo ser uma lesão nodular de baixo grau, parecendo muitas vezes maligna na ultra-sonografia. Isto pode então ser avaliado por ultra-sonografia, e se não houver fornecimento de sangue no interior, isto significa que não há tecido activo no interior, e pode então ser considerado como uma consolidação do hematoma depois de este ter sido absorvido. Os poucos tecidos removidos por biopsia perfurante devem ser examinados patologicamente, pois esta é a forma mais precisa de determinar a natureza do nódulo.