De um modo geral, as hormonas tiroideias baixas representam uma função tiroidiana baixa, também conhecida como hipotiroidismo. As causas clínicas comuns são doenças auto-imunes, tais como a tiroidite de Hashimoto, que podem levar a uma baixa função tiroideia. Há também o resultado do tratamento com iodo radioactivo, que causa o hipotiroidismo devido à radiação que mata as células funcionais da glândula tiróide. É também comum o tratamento cirúrgico cortar parte da glândula tiróide, causando o hipotiroidismo. Na prática clínica, os doentes com hipotiroidismo recebem normalmente suplementos hormonais da tiróide e são monitorizados regularmente. Existe também uma condição especial chamada síndrome de T3 baixa, que ocorre frequentemente em conjunto com doenças graves. Esta condição não requer normalmente a substituição da hormona tiróide, por isso, quando os níveis baixos de hormona tiróide estão presentes, é necessária uma consulta de endocrinologia.