A tiroidite pode ser ainda subdividida em diferentes tipos. Há algumas tiroidites que são autocura e outras que não o são. A maioria da tiroidite subaguda, após as fases hipertiróide e hipotiróide, pode ser recuperada o mais cedo possível sem tratamento específico adicional. A tiroidite séptica, por outro lado, requer medicação antibacteriana agressiva. Na tiroidite de Hashimoto, é dado um tratamento especial, dependendo do estádio da doença. Na fase hipertiróide, é indicado o tratamento anti-hipertiróide, enquanto na fase hipotiróide, é indicado o suplemento de tiroxina. Em conclusão, o tratamento subsequente da tiroidite deve ser determinado de acordo com o tipo de tiroidite e deve ser analisado caso a caso.