Levantar-se de manhã com uma boca amarga é principalmente um sintoma causado pelo refluxo da bílis para o estômago, provocando gastrite de refluxo biliar. A gastrite de refluxo biliar pode ser classificada como primária ou secundária. A gastrite de refluxo biliar é causada por uma cirurgia que destrói o piloro entre o estômago e o duodeno, que é a barreira natural do corpo. Uma vez removida cirurgicamente ou devido a outros factores cirúrgicos, a bílis no duodeno pode refluir directamente para o estômago, causando danos na mucosa gástrica devido à bílis e resultando numa boca amarga. As causas da gastrite primária de refluxo biliar são complexas, sendo comuns as doenças hepatobiliares e pancreáticas, como a hepatite, a colecistite, os cálculos biliares, a pancreatite ou a gastrite. Existem também medicamentos, como a aspirina ou outros medicamentos que causam disfunção gastrointestinal e podem provocar o refluxo da bílis para o estômago. Factores mentais, incluindo ansiedade e stress emocional, também podem causar refluxo biliar em resultado de perturbações gastrointestinais. Os hábitos alimentares e de estilo de vida, como petiscar, saltar o pequeno-almoço, fumar e abusar do álcool, podem levar ao refluxo biliar, que também pode causar uma boca amarga de manhã.