Em primeiro lugar, a água de limão contém uma grande quantidade de vitamina C, que tem um efeito oxidante e pode oxidar certos componentes do medicamento, tornando-o menos eficaz e causando efeitos secundários adversos em casos graves. Em segundo lugar, a água de limão contém substâncias ácidas que se podem combinar facilmente com as substâncias alcalinas do medicamento, afectando assim a sua eficácia e causando mesmo a sua deterioração e causando efeitos secundários adversos. Finalmente, se estiver a tomar medicamentos anti-inflamatórios ou analgésicos, bebê-lo com água de limão aumentará a sua irritação. Isto porque o próprio medicamento tem um efeito irritante na membrana mucosa do estômago, e se lhe for adicionada água de limão, pode aumentar a irritação do revestimento do estômago, o que pode levar à perfuração gástrica e à hemorragia em casos graves. Portanto, não é recomendado beber água de limão juntamente com medicamentos para evitar certos sintomas adversos que podem causar danos ao organismo.