A casca de Ginkgo biloba é tóxica e não é recomendada para consumo. A casca de Ginkgo biloba contém componentes de ácido cianídrico, especialmente no germe, e estes componentes têm um efeito ligeiramente corrosivo na pele. Os componentes da casca de ginkgo biloba podem causar alergias, bolhas e outros sintomas na pele após o contacto. Se as bagas de ginkgo não maduras forem consumidas por engano, pode ocorrer aperto no peito, palpitações (batimento cardíaco rápido, muitas vezes acompanhado de pânico), dor de cabeça, vómitos, visão turva, etc. e, em casos graves, convulsões ou espasmos. Se quiser consumir nozes de ginkgo, recomenda-se que retire o gérmen e descasque a pele, e que utilize nozes de ginkgo maduras para aquecer e fritar antes de consumir, o que pode reduzir a sua toxicidade. De um modo geral, as nozes de ginkgo, também conhecidas como frutos brancos, podem ser utilizadas na medicina tradicional chinesa. É de natureza achatada, de sabor ligeiramente amargo, e tem o efeito de parar a diarreia e tratar a asma e a tosse, bem como a leucorreia (urina turva como uma pasta branca). Embora contenha uma variedade de vitaminas e oligoelementos, o fruto do ginkgo biloba é tóxico e não se recomenda o seu consumo excessivo. Em caso de necessidade de medicação, esta deve ser utilizada sob controlo médico.