O sémen é constituído por espermatozóides e plasma seminal. O plasma seminal não é uma fonte única, mas é uma mistura das respectivas secreções da próstata, vesícula seminal, glândulas uretrais e epidídimo. Estas secreções têm acidez e alcalinidade diferentes e, quando misturadas, formam a acidez e a alcalinidade do sémen, que é o pH do sémen, indicando o estado de acidez e alcalinidade do sémen e reflectindo também a função secretora das diferentes glândulas sexuais acessórias, principalmente o líquido da próstata e as glândulas da vesícula seminal. O líquido prostático é branco leitoso, pH 6,5, de pequeno volume, geralmente 0,5 a 1 ml, constituindo cerca de 1/3 do volume do sémen, e é a primeira parte do sémen ejaculado que não coagula. Os componentes do líquido prostático estimulam a vitalidade dos espermatozóides e têm efeitos antibacterianos e imunossupressores. O líquido da vesícula seminal é amarelo leitoso, pH 7,2 a 8,0, em grandes quantidades, normalmente mais de 2 ml, e constitui cerca de 2/3 do volume do sémen, sendo a última parte do sémen ejaculado, que geralmente forma coágulos muito rapidamente. O líquido da vesícula espermática tem prostaglandinas na sua composição, que podem promover a contracção do músculo liso da uretra do homem para facilitar a ejaculação, e podem fazer com que a vagina da mulher se contraia após a relação sexual, promovendo o movimento dos espermatozóides. O líquido da glândula da vesícula seminal também contém substâncias que fornecem esperma. O líquido glandular uretral é claro, assemelha-se a clara de ovo diluída e é produzido em pequenas quantidades. É segregado durante a excitação sexual e constitui a parte inicial do sémen, lubrificando a uretra para facilitar a passagem dos fluidos subsequentes. O líquido epididimário é amarelo, viscoso e em quantidades muito pequenas. Constitui o ambiente extracorporal dos espermatozóides no epidídimo e participa na maturação dos espermatozóides. Uma quantidade muito pequena de urina é por vezes deixada no pénis e é também misturada no sémen durante a ejaculação. O breve contacto da urina com o esperma pode causar um efeito hipotónico de inchaço na cauda do esperma, resultando num ligeiro enrolamento da cauda. Estes fluidos são misturados durante a ejaculação e determinam o pH do sémen. O pH normal do sémen é de 7,2 a 8,0. Se o pH for inferior a 7,0 ou superior a 8,0, o sémen é anormal. Se o pH do sémen for inferior a 7,0, as glândulas seminais tendem a produzir pouco ou nenhum líquido, o que se deve ao subdesenvolvimento ou à ausência de espermatozóides, e os espermatozóides presentes no sémen morrem rapidamente. O sémen com um pH superior a 8,0 está associado a prostatite, em que o movimento dos espermatozóides é anormal e o tempo de sobrevivência é reduzido. Alguns homens podem ter vários graus de calcificação da glândula prostática ou calcificação da glândula da vesícula seminal, o que pode reduzir a quantidade de fluido produzido pela glândula e pode afectar o pH do sémen, devendo ser observado durante a análise do sémen.