O custo da cirurgia minimamente invasiva dos quistos de chocolate nos ovários é de cerca de 14.000 dólares. É aconselhável vir para o procedimento dentro de 3-7 dias após a limpeza menstrual completa. Esta é a taxa cobrada por um hospital terciário. É aconselhável fazer uma consulta antes de se fazer a cirurgia. Esta taxa não inclui o custo de check-ups ambulatórios antes da hospitalização, nem inclui o custo de nova verificação e continuação do tratamento após a alta. Os quistos de chocolate têm a possibilidade de recorrência, pelo que é importante continuar o tratamento após a cirurgia e fazer check-ups regulares, com exames de ultra-sons de seis em seis meses.