O aparelho de depilação a laser funciona apenas no folículo piloso e não tem qualquer efeito sobre a pele ou outros sistemas de órgãos. O princípio da depilação convencional a laser é que, através da acção fototérmica selectiva, o laser é enviado através da pele e actua directamente sobre os folículos pilosos mais profundos, tornando assim os folículos pilosos inactivos para que não cresça mais pêlo, basicamente sem qualquer efeito sobre a pele ou outros órgãos. Claro que nem todos os lasers são iguais, se for um hospital informal ou outra instalação de tratamento, a escolha e configuração da máquina não é razoável, ou o médico laser não tem experiência na depilação, e os parâmetros da máquina não são padrão, pode ter algum efeito sobre a pele, mas normalmente não há efeitos secundários óbvios sobre outros órgãos do corpo. Assim, as máquinas de depilação a laser são relativamente seguras e, desde que a máquina seja escolhida correctamente e os parâmetros do tratamento sejam escolhidos correctamente, não há normalmente danos adversos.