Um CA19-9 elevado deve ser considerado para condições inflamatórias do tracto gastrointestinal ou tumores gastrointestinais, tais como cancros gástricos, pancreáticos, biliares e colorrectais. Também precisa de ser combinado com TC ou ressonância magnética simples mais o melhoramento do abdómen superior e do abdómen inteiro, bem como a gastroscopia e a colonoscopia, e por fim a patologia como padrão de ouro para o diagnóstico de tumores. O CA19-9 é significativamente elevado em doentes com cancro do intestino, do estômago e do fígado. O CA19-9 é também elevado em graus variáveis em pancreatite aguda, colecistite, colangite colestática, cirrose hepática e hepatite.