As desvantagens da ablação de nódulos da tiroide incluem: em primeiro lugar, pode levar a uma cobertura incompleta da lesão e, em segundo lugar, é difícil obter amostras, o que limita a tipificação e caraterização do tumor, como se segue: 1. pode levar a uma cobertura incompleta das lesões: a gama de energia da ablação dos nódulos da tiroide é esférica, mas a forma irregular dos nódulos da tiroide é comum, pelo que existe normalmente tecido residual após a ablação, o que pode levar a uma cobertura incompleta das lesões. 2) Afetar a caraterização e a tipagem dos nódulos: A ablação dos nódulos da tiroide elimina os nódulos através de uma temperatura elevada, pelo que é difícil obter amostras de nódulos, afectando assim a tipagem e a caraterização dos tumores. Se o tumor for maligno, pode espalhar-se e metastizar devido à cobertura incompleta da lesão. Por conseguinte, as desvantagens da ablação de nódulos da tiroide incluem principalmente os dois aspectos acima referidos. O cumprimento ou não das indicações da ablação de nódulos deve ser avaliado pelo médico, sendo importante não ser negligente para não cometer um erro.