Os doentes com pielonefrite aguda têm de ser tratados de acordo com o agente patogénico infetante e também necessitam de tratamento geral, desde que o tratamento seja persistente, há esperança de uma cura completa.
A pielonefrite aguda é causada por agentes patogénicos que infectam a pelve renal e o parênquima renal, pelo que o tratamento se baseia principalmente na utilização de antibióticos contra os agentes patogénicos.
Para as infecções bacterianas gram-positivas e gram-negativas, podem ser utilizadas quinolonas, como a ofloxacina, a ciprofloxacina, etc. Para bacilos e cocos gram-positivos, podem ser utilizadas penicilinas semi-sintéticas, como a amoxicilina, para além de cefalosporinas, como a cefuroxima. Recomenda-se que sejam utilizadas sob a orientação de um médico.
Após os resultados da cultura de urina e da sensibilidade aos fármacos, deve optar-se por um tratamento antibiótico sensível.
Para além do tratamento com antibióticos, deve também ser efectuado um tratamento geral, o doente deve prestar atenção ao repouso, para os doentes com febre alta podem ser arrefecidos fisicamente, dar nutrição suficiente, prestar atenção para manter o equilíbrio hidroelectrolítico.
De um modo geral, a pielonefrite aguda pode ser curada através de um diagnóstico e tratamento razoáveis. Os medicamentos devem ser aplicados sob a orientação de médicos.