A endoftalmite é uma doença muito crítica em oftalmologia, uma vez que pode ter um impacto muito grave na visão e até levar à cegueira se não for tratada ou controlada atempadamente. Uma vez desenvolvida a endoftalmite, o primeiro passo consiste em administrar um tratamento anti-infeccioso de acordo com a causa específica, como a endoftalmite bacteriana, aplicando antibióticos tópicos e sistémicos para controlar a inflamação local, como gotas de antibiótico no olho, injecções intra-oculares de antibióticos, injecções subconjuntivais de antibióticos e gotas sistémicas, através das quais a inflamação é controlada no mais curto espaço de tempo possível para evitar danos na retina provocados por toxinas bacterianas. O prognóstico desta doença é geralmente muito mau. Se o tratamento for rápido, pode ser preservada alguma função visual, mas se as bactérias infectantes forem muito virulentas, a recuperação da visão é geralmente muito fraca.