A progesterona pode levar a efeitos secundários, os principais efeitos secundários são os seguintes: 1. A progesterona pode também levar a distúrbios menstruais e outros sintomas, tais como redução da menstruação ou amenorreia, e pode também ter impacto no funcionamento do fígado e dos rins. 4. As injecções de progesterona podem também levar a problemas hemorrágicos, tais como hemorragias vaginais com manchas ou corrimento cervical anormal, e podem também afectar o próprio peso, afectando directamente a saúde.