A morfina é um opióide e os seus efeitos secundários reflectem-se principalmente nas seguintes áreas: em primeiro lugar, o sistema respiratório, pode inibir o centro respiratório, levando a um abrandamento da frequência respiratória e a uma redução do volume corrente, o que pode levar a uma paragem respiratória quando a dose é demasiado elevada e a concentração é demasiado elevada. Em segundo lugar, o sistema circulatório, a morfina pode levar a uma diminuição da resistência vascular periférica, provocando uma diminuição da quantidade de sangue devolvido ao coração, resultando em hipotensão, inibição da contracção miocárdica, o que pode causar uma diminuição da frequência cardíaca. Terceiro, o sistema digestivo, a morfina pode inibir a peristalse do tracto gastrointestinal, causando náuseas, vómitos, obstipação e cólicas biliares. Em quarto lugar, pode também causar uma reacção alérgica ao medicamento devido à constituição pessoal, que pode levar a comichão, urticária, edema de garganta, e em casos graves, choque anafiláctico, que deve ser ressuscitado imediatamente.