A febre após a colonoscopia não está normalmente relacionada com a colonoscopia em si e é considerada como estando relacionada com lesões no próprio trato intestinal, como gastroenterite aguda, doença inflamatória intestinal, ou pode ser causada por outras doenças, como infecções do trato respiratório. A colonoscopia não provoca habitualmente doenças inflamatórias, pelo que a febre após a colonoscopia não está, na maioria dos casos, relacionada com o exame. Considera-se que a febre após a colonoscopia está relacionada com as lesões do próprio trato intestinal, tais como doentes com gastroenterite aguda, febre, dor abdominal, diarreia, náuseas, vómitos e outros sintomas; o ataque agudo da doença inflamatória intestinal também pode ter febre, e o grau de febre tornar-se-á gradualmente mais pesado com o desenvolvimento da doença. Além disso, a febre após a colonoscopia também pode ser causada por infeção do trato respiratório, quando vírus, bactérias e outros microorganismos patogénicos infectam o trato respiratório podem ocorrer após pneumonia, bronquite aguda e outras doenças, resultando em febre. Recomenda-se que a febre após a colonoscopia se dirija ao hospital e peça ao médico que faça uma avaliação para esclarecer a causa específica da doença.