A ablação minimamente invasiva da tiróide tem menos efeitos secundários e complicações. O procedimento pode proteger o tecido normal da tiróide de danos, mas pode causar efeitos secundários relacionados, tais como hemorragias, danos nervosos e vasculares, reacções febris e dor durante e após o procedimento, que têm uma incidência baixa e podem ser tratados sintomaticamente. Por exemplo, a utilização de analgésicos apropriados após a cirurgia pode aliviar a dor e o desconforto; a pressão arterial durante 30 minutos a duas horas pode prevenir hemorragias; reacções febris menores não requerem tratamento especial e podem desaparecer espontaneamente em 2-3 dias; lesões nervosas e vasculares são complicações graves, mas podem geralmente ser evitadas com a prática cirúrgica padrão e a injecção precisa de fluido de isolamento. Os pacientes recuperam rapidamente após a cirurgia e podem geralmente voltar ao trabalho normal em 1-2 dias.