Os quistos hepáticos não parasitários são doenças congénitas benignas e podem ser divididos em quistos isolados (solitários) e múltiplos e fígados policísticos, estes últimos frequentemente combinados com rins policísticos. Os quistos hepáticos são normalmente encontrados em mulheres e variam desde alguns mililitros em tamanho até vários litros em tamanho. O diagnóstico dos quistos hepáticos é facilmente estabelecido pelo ultra-som do modo B, que mostra uma área escura bem definida de fluido. Deve ter-se o cuidado de os diferenciar dos quistos hepáticos. Em quistos múltiplos, deve ser dada atenção às lesões císticas noutros órgãos. A maioria dos pequenos quistos não causam sintomas clínicos e não requerem tratamento. Os que se apresentam com sinais de compressão devem ser tratados. Em casos de grandes quistos em que a cirurgia não é indicada, a aspiração de cistos pode ser utilizada para obter alívio temporário. Os quistos grandes isolados podem ser tratados por abertura cirúrgica e remoção parcial da parede do cisto. Se o quisto estiver confinado a um lóbulo do fígado, o lóbulo também pode ser removido. Os quistos que são complicados pela infecção ou que estão ligados ao canal biliar devem ser tratados por ressecção para melhores resultados.