A dor intestinal ocorre geralmente à volta do umbigo, que é a parte média do intestino, que inclui o jejuno, íleo, cólon e recto. Quando ocorre dor intestinal, a localização da dor pode ser afectada pela presença de lesões nos diferentes trajectos intestinais. Como o jejuno e o íleo do intestino delgado estão principalmente à volta do umbigo, quando as lesões ocorrem no intestino delgado, a dor à volta do umbigo é a principal manifestação. O cólon encontra-se na periferia do intestino delgado, pelo que quando há uma lesão no cólon, a dor é mais distal ao umbigo. Quando a lesão não ocorre no cólon ascendente, o lado direito do abdómen é o local principal da dor, quando a lesão ocorre no cólon transversal, a dor é principalmente na parte transversal do abdómen superior, e no cólon descendente, o lado direito do abdómen é o local principal. O apêndice também faz parte do tracto intestinal e quando fica inflamado, também pode causar dor no intestino, principalmente na parte inferior direita do abdómen. Quando a doença intestinal está presente nas regiões sigmóide e rectal, a dor é predominantemente no abdómen inferior esquerdo.