Os quistos renais bilaterais não afectam normalmente a esperança de vida. O tratamento intempestivo pode causar hipertensão arterial ou obstrução ureteral. Os doentes com quistos renais são aconselhados a dirigir-se ao hospital o mais cedo possível e a colaborar ativamente com os médicos no tratamento. Os quistos renais bilaterais podem ser drenados do líquido cístico através da punção do quisto renal, podendo também ser injectados agentes esclerosantes, como o etanol anidro, para evitar a recorrência. Os quistos renais de grande diâmetro podem ser tratados por remoção cirúrgica dos quistos. A maioria dos doentes não afecta a função renal após o tratamento ativo, e o prognóstico é geralmente bom, basicamente não afectará a esperança de vida. Alguns doentes podem recidivar após o tratamento. Os quistos renais não tratados a longo prazo podem causar anomalias metabólicas nos rins, o que pode levar a hipertensão arterial e obstrução ureteral após compressão do ureter pelos quistos renais. Recomenda-se que os doentes com quistos renais duplos escolham o plano de tratamento adequado sob a orientação do médico, sendo necessária uma revisão regular após o tratamento para evitar a recorrência dos quistos.