Quando se tomam progesterona, podem produzir tonturas, dores de cabeça, náuseas, depressão e sensibilidade mamária, uma vez que produzem estimulação da função gastrointestinal após a administração oral, e algumas mulheres sentem perda de peso. Se não houver náuseas ou vómitos, a progesterona também pode causar edema generalizado, resultando em aumento de peso. As progesteronas orais também podem causar efeitos secundários, tais como hemorragia de ruptura ou hemorragia vaginal, que pode ser interrompida através do aumento moderado da dose de progesterona oral. Além disso, a natureza do corrimento cervical pode mudar como resultado do progestogénio oral, resultando num corrimento pegajoso leitoso ou amarelado. É importante cuidar bem da higiene da vulva para evitar a infecção cruzada. Também pode causar obstipação, que é um efeito secundário importante, pelo que é importante comer mais fruta e vegetais para evitar a obstipação grave.