A indigestão não é suscetível de causar obesidade porque os alimentos não podem ser bem absorvidos e digeridos e, por conseguinte, são propensos a desnutrição, obstipação, diarreia e anemia. Se houver dispepsia, os alimentos ingeridos não podem ser completamente digeridos e absorvidos pelo organismo, e a energia é insuficiente, pelo que não é fácil ficar sobrenutrido e levar à obesidade. A secreção insuficiente de pepsina e de ácido gástrico durante a indigestão pode afetar a absorção e a digestão no intestino delgado, facilitando a ocorrência de diarreia, perda de apetite e desconforto gástrico, bem como de obstipação. Quando a indigestão existe durante muito tempo, é fácil causar desnutrição, levando à ocorrência de anemia. Aos doentes com indigestão e obesidade, recomenda-se que se dirijam atempadamente ao hospital, sob a orientação do médico, para esclarecer as causas específicas da doença e efetuar um tratamento específico.