A enteroscopia consiste na introdução do colonoscópio pelo operador, a partir do ânus, no reto, no cólon sigmoide, etc., no processo de espelhamento que pode ser observado a partir do ecrã, para observar as lesões no trato intestinal.
As etapas de funcionamento da colonoscopia: o médico empurra lentamente o colonoscópio para o ânus, o reto, o cólon sigmoide, etc. do examinado e, à medida que o colonoscópio penetra no trato intestinal, ajusta o ângulo em conformidade, enquanto observa as lesões no trato intestinal no ecrã, tais como inflamação, pólipos, tumores e outras lesões, e depois retira lentamente o colonoscópio após o exame final.
Se necessário, pode ser efectuado um tratamento adequado sob o microscópio. A colonoscopia demora cerca de 15 minutos, sendo o tempo prolongado de acordo com o estado do doente.
Deve notar-se que a colonoscopia exige um elevado nível de preparação intestinal e que uma preparação intestinal de elevada qualidade é uma medida importante para reduzir a taxa de fuga de lesões. A preparação intestinal antes do exame inclui a preparação dietética e a purga de medicamentos. A preparação intestinal antes do exame deve ser efectuada em estrita conformidade com as recomendações médicas.