O abcesso da fístula dentária precisa de escolher diferentes métodos de tratamento de acordo com a localização da lesão, condições específicas, incluindo principalmente a drenagem do abcesso, tratamento medicamentoso, tratamento do canal radicular. Se o abcesso dentário ocorrer nas gengivas e noutros tecidos periodontais, considerado como abcesso periodontal, pode drenar o abcesso e enxaguar o tratamento anti-inflamatório, tomar medicamentos anti-infecciosos (como o metronidazol), controlar o abcesso e depois realizar o tratamento periodontal básico, para evitar a formação de abcesso periodontal novamente. Se o abcesso ocorrer na região apical do dente, é considerado um abcesso periapical e leva à formação de uma fístula, que precisa de ser tratada com terapia endodôntica, em primeiro lugar, limpar a cavidade pulpar de tecidos necróticos, depois desinfetar o canal radicular e, finalmente, preencher o canal radicular com enchimento. No caso de uma fístula, é importante procurar assistência médica para determinar a causa do problema e normalizar o tratamento sob controlo médico. Além disso, os medicamentos acima referidos também devem ser utilizados sob controlo médico.