O Aspergillus flavus pode, em geral, ser eliminado através de altas temperaturas, condições alcalinas, luz ultravioleta e outros métodos. 1) Alta temperatura: a toxicidade do Aspergillus flavus pode ser destruída a temperaturas muito elevadas, a pasteurização geral ou o calor normal de cozedura não são suficientes para o inativar completamente, pelo que a eliminação do Aspergillus flavus tem de ser efectuada em máquinas especiais de alta temperatura. 2) Remoção em condições alcalinas: A aflatoxina pode ser transformada numa substância solúvel em água em condições alcalinas, pelo que a aflatoxina pode ser removida pelo método de lavagem com água alcalina. 3) Lâmpada ultravioleta O princípio de funcionamento da lâmpada ultravioleta consiste em utilizar a elevada energia do espetro ultravioleta para destruir a estrutura dos microrganismos, com um forte efeito bactericida, de modo a atingir o objetivo de desinfeção, a irradiação com lâmpadas ultravioleta pode remover eficazmente a aflatoxina da superfície dos artigos. A aflatoxina é muito fácil de se reproduzir em cereais, culturas oleaginosas e alimentos com frutos secos, os seus danos para o corpo humano são maiores e o método geral de aquecimento é difícil de eliminar, pelo que se deve tentar evitar diariamente a ingestão de alimentos com bolor, não recomendando que se mate cegamente a aflatoxina.