A principal diferença entre a FIV de segunda geração e a de terceira geração é a aplicação diferente da população, a FIV de segunda geração destina-se principalmente a doentes com oligozoospermia grave, espermatozóides fracos, teratospermia ou azoospermia no parceiro masculino, e a FIV de terceira geração aplica-se principalmente a doentes com doença de um único gene no casal. A FIV de segunda geração ajuda principalmente os seguintes tipos de pacientes a engravidar, tais como oligozoospermia grave, espermatozóides fracos e teratogénese, etc. Para os pacientes que necessitam de se submeter a testes genéticos embrionários pré-implantação, a operação específica consiste em selecionar o sémen. Após a otimização do sémen, são seleccionados espermatozóides com aspeto normal e boa vitalidade, que são adicionados diretamente aos óvulos para completar todo o processo de fertilização. A fertilização in vitro de terceira geração deve, em primeiro lugar, efetuar o exame dos cromossomas embrionários em todos os embriões bem classificados antes da transferência dos embriões, selecionar os embriões com um exame cromossómico normal e, em seguida, proceder à transferência. A FIV de terceira geração é um método de conceção assistida utilizado para prevenir a transmissão de doenças hereditárias à geração seguinte, a fim de evitar que um ou ambos os cônjuges do paciente desenvolvam uma doença hereditária familiar. A FIV de segunda e terceira geração têm as suas próprias vantagens e o melhor plano de tratamento deve ser adotado sob a orientação de um médico.