As pedras das amígdalas caem com um buraco e são consideradas criptas amigdalinas. A cripta amigdalina é uma estrutura normal das amígdalas, mas devido ao efeito de expansão do cálculo amigdalino, a cripta é alargada e parece um buraco a olho nu. Este buraco não cicatriza e, após a remoção do cálculo, a cripta pode diminuir gradualmente à medida que o tecido da amígdala se torna mais elástico por si próprio.
A superfície do tecido da amígdala parece lisa e plana, mas na realidade a superfície da amígdala tem muitos pequenos buracos de diferentes profundidades, que são clinicamente conhecidos como criptas amigdalianas. As criptas amigdalinas são tubos cegos formados quando o epitélio das amígdalas mergulha e cresce na substância das amígdalas, o que é uma estrutura normal das amígdalas. Em circunstâncias normais, a abertura da cripta é tão pequena que não é fácil de distinguir a olho nu.
A formação de pedras nas amígdalas está relacionada com uma variedade de factores, tais como resíduos alimentares, estimulação inflamatória, e as pedras das amígdalas são depositadas na cripta das amígdalas. Portanto, após a queda dos cálculos amigdalianos, a fossa amigdaliana só é aumentada a olho nu, o buraco pode encolher gradualmente com a elasticidade do tecido da amígdala, mas, em essência, é incapaz de “curar” como uma ferida tradicional.