Se houver danos na mucosa intestinal, as fezes devem ser vermelho vivo, com sangue nas fezes no nível baixo e vermelho escuro no nível alto, mas a mucosa intestinal raramente é deslocada e é extremamente rara na prática clínica. Os danos na mucosa intestinal podem ser ulcerados ou infiltrados por um tumor. Os tumores de grau elevado têm normalmente obstrução, movimentos intestinais sem forma, dor abdominal e sangue suave nas fezes, enquanto que nos tumores de grau baixo o sangue nas fezes é mais grave. Na colite ulcerosa, há também alterações na natureza dos movimentos intestinais, incluindo aumento de muco e sangue ligeiro nas fezes. Raramente, a doença de Crohn do cólon manifesta-se também por alterações na forma das fezes, tais como sangue e muco nas fezes.