Quando a doença de Kawasaki se desenvolve em crianças pequenas, os danos nas artérias coronárias, como aneurismas coronários ou estreitamento, oclusão ou dilatação das artérias coronárias, ocorrem geralmente dentro de duas semanas após o início da doença. Em particular, as crianças com uma idade de início mais jovem, com febre persistente e sinais clínicos de miocardite, têm uma maior probabilidade de lesão das artérias coronárias. Uma vez ocorrida, é necessário um tratamento rápido e agressivo, como o tratamento com doses elevadas de aspirina ou de imunoglobulina e, posteriormente, um tratamento de manutenção com doses de aspirina anti-agregação plaquetária.